本研究利用MISA软件对毛红椿28 725条Unigene序列进行SSR位点检测，在10 764条Unigene序列中检测出14 106个SSR位点，SSR发生频率为37.47%，平均每5.18 kb出现一个SSR位点。优势重复基元以单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复为主，分别占比为56.64%、20.91%、19.62%。SSR位点核苷酸重复基元类型共有215种，主要以单核苷酸重复类型A/T为主，占总SSR数量的55.54%；SSR重复类型以9~12重复次数最多，占总数的48.00%。用Primer 3软件对含有SSR位点的序列进行批量设计引物，合成320对SSR引物，获得7对多态性引物，在20个样品中进行毛细管电泳检测，共检测到26个等位基因，平均等位基因数为3.71个，平均有效等位基因数为2.06个，平均Shannon多样性指数(I)为0.8 523，平均多态性信息含量(PIC)为0.4 344，其中MC85、TM121和TM96为高度多态性位点(PIC＞0.5)。结果表明基于毛红椿转录组序列开发的SSR引物可用于毛红椿种群遗传多样性研究，为毛红椿遗传背景研究奠定基础。

上述研究成果在刊物《分子植物育种》上，江西省森林培育重点实验室潘蓉蓉为第一作者，张露教授为通讯作者。